Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH1Q15438 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTH1Q15438 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms