Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE3CQ15386 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3CQ15386 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms