Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCM1Q15154 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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