Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMCO1Q147U7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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