Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERV3-1Q14264 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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ERV3-1Q14264 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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ERV3-1Q14264 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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ERV3-1Q14264 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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ERV3-1Q14264 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERV3-1Q14264 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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