Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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