Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA9Q13797 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms