Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMB3Q13751 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMB3Q13751 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMB3Q13751 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMB3Q13751 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMB3Q13751 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMB3Q13751 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMB3Q13751 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LAMB3Q13751 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB3Q13751 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms