Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP1A4Q13733 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1A4Q13733 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms