Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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