Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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DNASE1L3Q13609 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNASE1L3Q13609 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNASE1L3Q13609 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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