Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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