Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRF5Q13568 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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