Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf61Q13536 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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