Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTM1Q13496 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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