Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PMS2P3Q13401 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P3Q13401 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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