Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF6Q13247 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF6Q13247 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF6Q13247 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF6Q13247 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF6Q13247 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF6Q13247 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF6Q13247 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF6Q13247 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF6Q13247 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF6Q13247 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRSF6Q13247 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF6Q13247 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF6Q13247 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRSF6Q13247 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF6Q13247 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF6Q13247 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF6Q13247 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRSF6Q13247 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF6Q13247 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF6Q13247 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF6Q13247 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF6Q13247 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF6Q13247 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF6Q13247 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF6Q13247 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF6Q13247 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRSF6Q13247 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF6Q13247 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF6Q13247 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF6Q13247 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF6Q13247 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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