Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
GRIN2BQ13224 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2BQ13224 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC37.88■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GRIN2BQ13224 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
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