Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX3Q13185 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBX3Q13185 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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