Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPFIA1Q13136 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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