Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3Q13114 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms