Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF1Q13077 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF1Q13077 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms