Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ECH1Q13011 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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