Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK2Q13002 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
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