Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXC1Q12948 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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FOXC1Q12948 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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FOXC1Q12948 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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FOXC1Q12948 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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FOXC1Q12948 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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FOXC1Q12948 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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FOXC1Q12948 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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FOXC1Q12948 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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