Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN2Q12907 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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