Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN1Q12860 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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CNTN1Q12860 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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CNTN1Q12860 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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CNTN1Q12860 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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CNTN1Q12860 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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CNTN1Q12860 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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CNTN1Q12860 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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CNTN1Q12860 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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