Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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RAB40BQ12829 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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RAB40BQ12829 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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RAB40BQ12829 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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RAB40BQ12829 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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RAB40BQ12829 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB40BQ12829 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB40BQ12829 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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RAB40BQ12829 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB40BQ12829 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB40BQ12829 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB40BQ12829 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB40BQ12829 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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