Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROAPQ12815 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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