Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWF1Q12792 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TWF1Q12792 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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