Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMA1Q12791 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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