Protein–RNA interactions for Protein: Q12470

TY1A-NL2, Transposon Ty1-NL2 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL2Q12470 SEC22YLR268W 645 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 VPS38YLR360W 1320 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YML040WYML040W 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YML045W-AYML045W-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 PRM6YML047C 1059 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YMR051CYMR051C 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YNL122CYNL122C 348 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 CBP3YPL215W 1008 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 VPS4YPR173C 1314 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 BEM1YBR200W 1656 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 CTF3YLR381W 2202 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 FRE5YOR384W 2085 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 NDE1YMR145C 1683 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 GAS5YOL030W 1455 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YMR034CYMR034C 1305 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YCP4YCR004C 744 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 ESS1YJR017C 513 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YNL337WYNL337W 255 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 TRM1YDR120C 1713 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 ADE2YOR128C 1716 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 SRV2YNL138W 1581 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 GDI1YER136W 1356 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 RHB1YCR027C 630 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 ERP3YDL018C 678 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YER133W-AYER133W-A 342 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YGL109WYGL109W 324 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 RTT102YGR275W 474 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 LOH1YJL038C 660 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 GAL3YDR009W 1563 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 HAL5YJL165C 2568 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 TPS1YBR126C 1488 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 RAD57YDR004W 1383 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 SLD2YKL108W 1362 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 MSW1YDR268W 1140 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 MEI4YER044C-A 1227 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 AGA2YGL032C 264 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YGR064WYGR064W 369 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 THP2YHR167W 786 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 SFT1YKL006C-A 294 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YKL063CYKL063C 504 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 ENV10YLR065C 546 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 POP7YBR167C 423 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 PCL8YPL219W 1479 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 UBX3YDL091C 1368 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 ENT1YDL161W 1365 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 ESA1YOR244W 1338 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 RPL13AYDL082W 600 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 TRM8YDL201W 861 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 AGE2YIL044C 897 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 VPH2YKL119C 648 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YKR073CYKR073C 321 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 GPI15YNL038W 690 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 ATO2YNR002C 849 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YBL094CYBL094C 333 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YNR064CYNR064C 873 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 RRG7YOR305W 729 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 RET3YPL010W 570 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YPL113CYPL113C 1191 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 CMR1YDL156W 1569 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 RTG2YGL252C 1767 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 KGD2YDR148C 1392 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 LTV1YKL143W 1392 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 NOP7YGR103W 1818 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YIL108WYIL108W 2091 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 CDC50YCR094W 1176 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YJL193WYJL193W 1209 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 MDE1YJR024C 735 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YLR124WYLR124W 345 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 TMA23YMR269W 636 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 RCN2YOR220W 798 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 RFS1YBR052C 633 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 YPL264CYPL264C 1062 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 CDC28YBR160W 897 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 RPS9BYBR189W 588 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 KEL3YPL263C 1956 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 HXT9YJL219W 1704 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL2Q12470 RTT106YNL206C 1368 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 YMD8YML038C 1329 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 snR86snR86 1004 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 SPG3YDR504C 384 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 UBC6YER100W 753 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 SPT15YER148W 723 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 SNO3YFL060C 669 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 OST5YGL226C-A 261 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 FLX1YIL134W 936 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 TPK1YJL164C 1194 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 SNO2YNL334C 669 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 LEE1YPL054W 906 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 RFC5YBR087W 1065 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL2Q12470 CCR4YAL021C 2514 nt7.08□□□□□ -1.28
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