Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFX4

Putative uncharacterized protein LOC100128554, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q0VFX4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q0VFX4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q0VFX4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q0VFX4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q0VFX4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q0VFX4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q0VFX4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q0VFX4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q0VFX4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q0VFX4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q0VFX4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q0VFX4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q0VFX4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q0VFX4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q0VFX4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q0VFX4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q0VFX4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q0VFX4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q0VFX4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q0VFX4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q0VFX4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q0VFX4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q0VFX4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q0VFX4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q0VFX4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q0VFX4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q0VFX4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q0VFX4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q0VFX4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q0VFX4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q0VFX4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q0VFX4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q0VFX4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q0VFX4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q0VFX4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q0VFX4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q0VFX4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q0VFX4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q0VFX4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q0VFX4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q0VFX4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q0VFX4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q0VFX4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q0VFX4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q0VFX4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q0VFX4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q0VFX4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q0VFX4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms