Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC15Q0P6D6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms