Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms