Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD47Q08722 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD47Q08722 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD47Q08722 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD47Q08722 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD47Q08722 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD47Q08722 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD47Q08722 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD47Q08722 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CD47Q08722 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD47Q08722 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD47Q08722 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD47Q08722 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD47Q08722 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CD47Q08722 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD47Q08722 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD47Q08722 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD47Q08722 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD47Q08722 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CD47Q08722 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD47Q08722 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD47Q08722 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD47Q08722 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD47Q08722 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD47Q08722 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD47Q08722 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD47Q08722 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD47Q08722 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD47Q08722 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD47Q08722 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD47Q08722 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD47Q08722 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD47Q08722 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD47Q08722 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD47Q08722 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD47Q08722 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD47Q08722 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CD47Q08722 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CD47Q08722 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD47Q08722 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD47Q08722 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD47Q08722 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD47Q08722 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD47Q08722 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CD47Q08722 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD47Q08722 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD47Q08722 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD47Q08722 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD47Q08722 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CD47Q08722 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD47Q08722 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms