Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP3CAQ08209 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms