Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOX4Q06945 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX4Q06945 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms