Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms