Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LTBQ06643 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LTBQ06643 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTBQ06643 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTBQ06643 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTBQ06643 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTBQ06643 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTBQ06643 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTBQ06643 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LTBQ06643 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTBQ06643 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTBQ06643 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTBQ06643 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTBQ06643 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LTBQ06643 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LTBQ06643 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LTBQ06643 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LTBQ06643 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LTBQ06643 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTBQ06643 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LTBQ06643 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LTBQ06643 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LTBQ06643 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTBQ06643 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTBQ06643 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTBQ06643 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTBQ06643 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LTBQ06643 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTBQ06643 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTBQ06643 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTBQ06643 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTBQ06643 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTBQ06643 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTBQ06643 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTBQ06643 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTBQ06643 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LTBQ06643 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTBQ06643 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTBQ06643 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTBQ06643 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTBQ06643 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTBQ06643 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LTBQ06643 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms