Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTF1Q05048 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms