Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 MLF3YNL074C 1359 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 RTT103YDR289C 1230 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YGR291CYGR291C 222 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 ISY1YJR050W 708 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 PHA2YNL316C 1005 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 LEM3YNL323W 1245 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 MSH1YHR120W 2880 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 ATR1YML116W 1629 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 GAL10YBR019C 2100 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 HES1YOR237W 1305 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 ACT1YFL039C 1128 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 MIM2YLR099W-A 264 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 ATG33YLR356W 594 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 MAC1YMR021C 1254 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 MET3YJR010W 1536 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 UBP7YIL156W 3216 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 SLT2YHR030C 1455 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 MMT2YPL224C 1455 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 RKM2YDR198C 1440 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 ORC6YHR118C 1308 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YCR006CYCR006C 474 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YJL107CYJL107C 1164 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 TAF4YMR005W 1167 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 DSE3YOR264W 1293 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 SCO1YBR037C 888 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 RIM21YNL294C 1602 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 GPI18YBR004C 1302 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 RPN12YFR052W 825 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 MMS2YGL087C 414 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 PAL1YDR348C 1500 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 MDR1YGR100W 2853 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 TIF4632YGL049C 2745 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 IZH3YLR023C 1632 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 COQ4YDR204W 1008 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 ERD1YDR414C 1089 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 RPA49YNL248C 1248 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YOR024WYOR024W 324 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YBR016WYBR016W 387 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YPL260WYPL260W 1656 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 DNF2YDR093W 4839 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 ATG1YGL180W 2694 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 CLB4YLR210W 1383 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 SSA2YLL024C 1920 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 GCV1YDR019C 1203 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 SPT3YDR392W 1014 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 PUS6YGR169C 1215 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YIL028WYIL028W 399 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 YKR104WYKR104W 921 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 ECM15YBL001C 315 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 HEM15YOR176W 1182 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN11Q04712 NNK1YKL171W 2787 nt4.77□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 AVT1YJR001W 1809 nt4.77□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 IWR1YDL115C 1062 nt4.77□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 ARP10YDR106W 855 nt4.77□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 RAI1YGL246C 1164 nt4.77□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 GAT3YLR013W 426 nt4.77□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 PDX3YBR035C 687 nt4.77□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 MDM30YLR368W 1797 nt4.77□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 SSB1YDL229W 1842 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 SSB2YNL209W 1842 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 SBE2YDR351W 2595 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 TFC7YOR110W 1308 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 MRE11YMR224C 2079 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 SEM1YDR363W-A 270 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 YGL118CYGL118C 438 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 LAS21YJL062W 2493 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 XPT1YJR133W 630 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 PEX22YAL055W 543 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 SKG1YKR100C 1068 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 IMP2YMR035W 534 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 TOM40YMR203W 1164 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 APC1YNL172W 5247 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.76□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 WHI4YDL224C 1950 nt4.75□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 SLD2YKL108W 1362 nt4.75□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 DRN1YGR093W 1524 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 MNN10YDR245W 1182 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 YHP1YDR451C 1062 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 NAG1YGR031C-A 492 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 PFK1YGR240C 2964 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 YKR075CYKR075C 924 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 CTR3YLR411W 726 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 GTR1YML121W 933 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 RFA2YNL312W 822 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 PUS1YPL212C 1635 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 RSM23YGL129C 1353 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 ATG20YDL113C 1923 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 HOM3YER052C 1584 nt4.74□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 CTS1YLR286C 1689 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 STB2YMR053C 2553 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 ALD3YMR169C 1521 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 ALD2YMR170C 1521 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 TEF4YKL081W 1239 nt4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.8 ms