Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC4Q03721 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC4Q03721 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms