Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG1Q02413 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.5 ms