Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BDH1Q02338 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BDH1Q02338 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms