Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTN2Q02246 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN2Q02246 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms