Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms