Protein–RNA interactions for Protein: Q01085

TIAL1, Nucleolysin TIAR, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIAL1Q01085 ABCA11P-203ENST00000507854 1503 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 22.8
TIAL1Q01085 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 22.8
TIAL1Q01085 ZNF721-206ENST00000515578 1679 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 22.8
TIAL1Q01085 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 22.8
TIAL1Q01085 ZNF721-202ENST00000505900 664 ntTSL 1 (best)6.88□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 22.8
TIAL1Q01085 ABCA11P-204ENST00000514396 1423 ntTSL 1 (best)6.09□□□□□ -1.432e-6■■■■□ 22.8
TIAL1Q01085 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 22.8
TIAL1Q01085 ZNF721-204ENST00000507078 355 ntTSL 52.52□□□□□ -2.012e-6■■■■□ 22.8
TIAL1Q01085 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.164e-15■■■■□ 22.8
TIAL1Q01085 LUC7L3-219ENST00000511974 507 ntTSL 34.42□□□□□ -1.74e-15■■■■□ 22.8
TIAL1Q01085 PTPN4-208ENST00000460289 577 ntTSL 422.04■■□□□ 1.129e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PTPN4-207ENST00000460162 623 ntTSL 421.59■■□□□ 1.059e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PTPN4-211ENST00000488279 662 ntTSL 521.45■■□□□ 1.029e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-210ENST00000458280 553 ntTSL 420.96■□□□□ 0.959e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PTPN4-202ENST00000420482 568 ntTSL 420.2■□□□□ 0.829e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-223ENST00000511662 441 ntTSL 518.43■□□□□ 0.549e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.479e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.479e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-208ENST00000412911 560 ntTSL 416.51■□□□□ 0.239e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PKP4-204ENST00000421462 3099 ntTSL 216.38■□□□□ 0.219e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.199e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.069e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-217ENST00000490700 661 ntTSL 315.36■□□□□ 0.059e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 HERPUD1-219ENST00000570273 1425 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.019e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-227ENST00000513641 577 ntTSL 514.87□□□□□ -0.039e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-211ENST00000507210 582 ntTSL 314.77□□□□□ -0.059e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-201ENST00000312283 785 ntTSL 314.65□□□□□ -0.069e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-215ENST00000476384 936 ntTSL 514.55□□□□□ -0.089e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-216ENST00000483434 874 ntTSL 313.72□□□□□ -0.219e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-213ENST00000467096 942 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-211ENST00000460655 572 ntTSL 412.75□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-220ENST00000509963 432 ntTSL 212.67□□□□□ -0.389e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-215ENST00000508996 348 ntTSL 412.55□□□□□ -0.49e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.419e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-219ENST00000496003 815 ntTSL 512.17□□□□□ -0.469e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-219ENST00000509664 538 ntTSL 511.86□□□□□ -0.519e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-217ENST00000509164 563 ntTSL 411.59□□□□□ -0.559e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.569e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 ZRANB2-207ENST00000611683 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.629e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-205ENST00000444354 1756 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.629e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-203ENST00000396448 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.639e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-220ENST00000496117 528 ntTSL 510.98□□□□□ -0.659e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.659e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-228ENST00000514981 653 ntTSL 310.98□□□□□ -0.659e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.79e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-201ENST00000264312 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.729e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.779e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.789e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-203ENST00000358029 4329 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.839e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PKP4-203ENST00000411900 552 ntTSL 49.58□□□□□ -0.889e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-206ENST00000371132 4552 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.899e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-214ENST00000468590 691 ntTSL 59.44□□□□□ -0.99e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-218ENST00000493301 597 ntTSL 39.44□□□□□ -0.99e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.99e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.939e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PKP4-208ENST00000462335 561 ntTSL 49.19□□□□□ -0.949e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-210ENST00000506801 571 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.969e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-224ENST00000512236 594 ntTSL 38.99□□□□□ -0.979e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-225ENST00000512981 1209 ntTSL 48.9□□□□□ -0.989e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-212ENST00000507546 496 ntTSL 28.81□□□□□ -19e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-221ENST00000510824 582 ntTSL 38.81□□□□□ -19e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 UACA-203ENST00000539319 4026 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.029e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 38.26□□□□□ -1.099e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.159e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.219e-13■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.249e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-209ENST00000505922 555 ntTSL 57.1□□□□□ -1.279e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 ZRANB2-203ENST00000473260 482 ntTSL 26.89□□□□□ -1.319e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 STX16-212ENST00000464640 812 ntTSL 26.87□□□□□ -1.319e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 GFPT1-204ENST00000494201 625 ntTSL 56.33□□□□□ -1.49e-13■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 ZRANB2-206ENST00000487510 579 ntTSL 26.24□□□□□ -1.419e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 UACA-212ENST00000560523 1183 ntTSL 56.14□□□□□ -1.439e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.439e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 UACA-205ENST00000558758 2060 ntTSL 1 (best)5.87□□□□□ -1.479e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.479e-13■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 ZRANB2-205ENST00000479947 470 ntTSL 25.59□□□□□ -1.519e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.649e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 UACA-210ENST00000560167 749 ntTSL 44.71□□□□□ -1.669e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.669e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PTPN4-210ENST00000485247 590 ntTSL 34.65□□□□□ -1.679e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-207ENST00000503016 720 ntTSL 34.26□□□□□ -1.739e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-218ENST00000509246 495 ntTSL 24.17□□□□□ -1.749e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.849e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-208ENST00000504654 552 ntTSL 33.21□□□□□ -1.99e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 OCIAD1-222ENST00000511102 688 ntTSL 23.17□□□□□ -1.99e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 ZRANB2-204ENST00000477096 3677 ntTSL 1 (best)1.68□□□□□ -2.149e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 SFPQ-202ENST00000460428 464 ntTSL 28.06□□□□□ -1.121e-8■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 53.82□□□□□ -1.81e-8■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 TCF7L2-208ENST00000369389 691 ntTSL 423.43■■□□□ 1.342e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 TCF7L2-223ENST00000629706 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 TCF7L2-205ENST00000355717 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 TCF7L2-204ENST00000352065 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 TCF7L2-229ENST00000637416 576 ntTSL 43.24□□□□□ -1.892e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 TCF7L2-225ENST00000636309 563 ntTSL 53.23□□□□□ -1.892e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 22.7
Retrieved 100 of 8,119 protein–RNA pairs in 116.5 ms