Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF9Q00978 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF9Q00978 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF9Q00978 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms