Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1BQ00975 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1BQ00975 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms